研究报告

山核桃MITE序列识别和MITE-PCR反应体系的建立  

夏晓庆 , 董昂 , 曾燕如*
浙江农林大学,省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,杭州, 311300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 26 篇   
收稿日期: 2019年08月12日    接受日期: 2019年08月22日    发表日期: 2020年10月30日
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摘要

微型反向重复转座元件(miniature inverted repeat transposable elements, MITEs)在植物中广泛分布,可产生适应性的遗传变异,尤其可在非重组无性繁殖物种中产生变异,可用于遗传多样性分析。为促进山核桃的遗传学研究,本研究运用 MITE Digger软件对山核桃基因组测序数据进行扫描,共识别得到 739条山核桃 MITE序列。基于 MITE序列,使用 Primer-BLAST在线设计引物 680对,占 MITE序列的 92.02%。基于小麦的 MITE-PCR体系,通过降低退火温度 5优化了山核桃的反应体系。随机挑选 300对引物进行筛选,其中 108对引物具有稳定的扩增产物。108对引物中 100对引物在不同单株山核桃个体中扩增呈现单条带,占92.6%8对引物扩增呈现双条带,占 7.4%PCR产物测序结果发现,呈现单条带的 PCR扩增产物均包含MITE序列,但呈现双条带的 PCR扩增产物中大多不含有 MITE序列。研究结果为山核桃遗传多样性研究提供了科学依据。
 

关键词
山核桃(Carya cathayensis);转座子;MITE

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《分子植物育种》印刷版
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